subcellbarcode

doi:10.18129/b9.bioc.subcellbarcode

该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅subcellbarcode

subcellbarcode:集成的工作流程,用于可靠的映射和可视化整个人类空间蛋白质组

生物导体版本:3.12

基于质谱的空间蛋白质组学已使蛋白质亚细胞定位的蛋白质范围映射(Orre等,2019,Molecular细胞)。子校长r软件包可鲁棒地将蛋白质分类为相应的亚细胞定位。

作者:Taner Arslan

维护者:taner arslan

引用(从r内,输入引用(“ subcellbarcode”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ subcellbarcode”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ subcellbarcode”)

html R脚本 子校长r降价小插图
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 分类,,,,质谱,,,,蛋白质组学,,,,软件
版本 1.6.0
在生物导体中 Bioc 3.9(R-3.6)(2年)
执照 GPL-2
要看 R(> = 3.6)
进口 RTSNE,,,,STACTPLOT3D,,,,商在,,,,E1071,,,,GGPLOT2,,,,栅格,,,,NetworkD3,,,,Ggrepel,图形,统计信息,org.hs.eg.db,,,,AnnotationDbi
链接
建议 尼特,,,,rmarkDown,,,,生物使用
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 subcellbarcode_1.6.0.tar.gz
Windows二进制 subcellbarcode_1.6.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) subcellbarcode_1.6.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/subcellbarcode
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/subcellbarcode
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/subcellbarcode/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • 正常词 邮件列表 - 包装开发人员bob电竞体育官网