SpatialExperiment

DOI:10.18129 / B9.bioc.SpatialExperiment

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见SpatialExperiment．

空间实验处理S4班

Bioconductor版本:3.12

定义用于存储空间实验数据的S4类。主要的例子是用seqFISH和10x-Visium空间基因表达数据报道的。这包括用于存储、检索空间坐标、10倍专用参数及其处理的专门方法。

作者:Dario Righelli [aut, cre]， Davide Risso [aut]

维护者:Dario Righelli < Dario。Righelli在gmail.com>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("SpatialExperiment")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“SpatialExperiment”)

超文本标记语言	R脚本	10x-Visum空间数据分析
超文本标记语言	R脚本	seqFISH空间数据工作流
PDF		参考手册
文本		自述
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport，DataRepresentation，ImmunoOncology，基础设施，SingleCell，软件
版本	1.0.0
在Bioconductor	BioC 3.12 (R-4.0)(0.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R(>= 4.0.0)，方法，SingleCellExperiment
进口	S4Vectors
链接
建议	testthat，knitr，rjson，矩阵
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/drighelli/SpatialExperiment/issues
全靠我
进口我	SingleCellMultiModal，spatialLIBD
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	SpatialExperiment_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	SpatialExperiment_1.0.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	SpatialExperiment_1.0.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SpatialExperiment
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/SpatialExperiment
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/SpatialExperiment/
软件包下载报告	下载数据