SingleCellSignalR

DOI:10.18129 / B9.bioc.SingleCellSignalR

这个包是3.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅SingleCellSignalR。

细胞信号使用单细胞RNAseq数据分析

Bioconductor版本:3.12

允许单个细胞RNA seq数据分析,聚类,创建内部网络和推断信息交互。

作者:西蒙Cabello-Aguilar (aut),雅克Colinge (cre, aut)

维护人员:雅克Colinge <雅克。colinge在inserm.fr >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“SingleCellSignalR”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“SingleCellSignalR”)

HTML	R脚本	my-vignette
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	分类,聚类,网络,RNASeq,SingleCell,软件
版本	1.2.0
Bioconductor自	BioC 3.11 (r - 4.0)(1年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 4.0)
进口	BiocManager,circlize,limma,igraph,gplotsgrDevices,刨边机,SIMLR,data.table,pheatmap统计数据,Rtsne、图形、stringr,foreach,乘,食物,跑龙套
链接
建议	knitr,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我	tidySingleCellExperiment
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	SingleCellSignalR_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	SingleCellSignalR_1.2.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	SingleCellSignalR_1.2.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SingleCellSignalR
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ SingleCellSignalR
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/SingleCellSignalR/
包下载报告	下载数据