SimFFPE

DOI:10.18129 / B9.bioc.SimFFPE

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见SimFFPE．

用于FFPE组织的NGS读取模拟器

Bioconductor版本:3.12

该包模拟在福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织的下一代测序(NGS)过程中特别生成的人工制品嵌合读取。

作者:魏兰英

维护者:卫兰英<兰英。Wei在uni-muenster.de>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("SimFFPE")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“SimFFPE”)

PDF	R脚本	SimFFPE简介
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	对齐，DataImport，MultipleComparison，SequenceMatching，测序，软件
版本	1.2.0
在Bioconductor	BioC 3.11 (R-4.0)(1年)
许可证	LGPL-3
取决于	Biostrings
进口	dplyr，foreach，doParallel，truncnorm，GenomicRanges，IRanges，Rsamtools，并行，图形，统计，utils，方法
链接
建议	BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	SimFFPE_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	SimFFPE_1.2.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	SimFFPE_1.2.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SimFFPE
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/SimFFPE
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/SimFFPE/
软件包下载报告	下载数据