srgnet
doi：10.18129/b9.bioc.srgnet
该包适用于生物导体的3.12版；对于稳定的最新版本，请参阅srgnet。
SRGNET：用于研究转录组学数据对基因突变的协同反应的R包装
生物导体版本：3.12
我们开发了SRGNET，以分析转录组曲线中的协同调节机制，这些机制起作用，以增强突变，药物或环境暴露组合的整体细胞反应。该软件包可用于识别协同反应基因下游的调节模块，优先考虑可能是潜在干预靶标的协同调节基因，并将基因扰动实验的背景化。
作者：Isar Nassiri [AUT，CRE]，Matthew McCall [AUT，CRE]
维护者：urmc.rochester.edu>的isar nassiri
引用（从r内，输入引用（“ srgnet”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ srgnet”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ srgnet”）
| html | SRGNET的R包，用于研究转录组学数据对基因突变的协同反应\ | |
| 参考手册 |
细节
| 生物浏览 | 回归，，，，软件，，，，统计信息 |
| 版本 | 1.16.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.4（R-3.3）（4。5年） |
| 执照 | GPL-2 |
| 要看 | r（> = 3.3.1），EBCoExpress，，，，大量的，，，，Igraph，，，，PVCLUST（> = 2.0-0），GBM（> = 2.1.1），林玛，dmwr（> = 0.4.1），矩阵，，，，HMISC |
| 进口 | |
| 链接 | |
| 建议 | 尼特，，，，rmarkDown |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | srgnet_1.16.0.tar.gz |
| Windows二进制 | srgnet_1.16.0.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | srgnet_1.16.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/srgnet |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/srgnet |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/srgnet/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
