分裂

DOI:10.18129 / B9.bioc.SPLINTER

此包适用于Bioconductor的3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见分裂

文本拼接解释器

Bioconductor版本:3.12

提供工具来分析可选的剪接位点,根据序列信息解释结果,为位点验证选择和设计引物,并给出事件的可视化表示,以指导下游实验。

作者:Diana Low [au, cre]

维护者:Diana Low

引用(从R中,输入引用(“分裂”)):

安装

要安装此包,启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“分裂”)

PDF R脚本 分裂
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews AlternativeSplicingGeneExpressionImmunoOncologyRNASeq软件可视化
版本 1.16.0
在Bioconductor公司 BioC 3.4 (R-3.3)(4.5年)
许可证 GPL-2
取决于 R (>= 3.6.0), grDevices, stats
进口 图形,ggplot2seqLogoBiostringsbiomaRtGenomicAlignmentsGenomicRangesGenomicFeaturesGvizIRangesS4VectorsGenomeInfoDb跑龙套,plyrstringr、方法、BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9googleVis
链接
建议 BiocStyleknitrrmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/dianalow/SPLINTER/
BugReports https://github.com/dianalow/SPLINTER/issues
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包 SPLINTER_1.16.0.tar.gz
Windows二进制 SPLINTER_1.16.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) SPLINTER_1.16.0.tgz
源库 git clone https://git.bioconductor.org/packages/SPLINTER
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/SPLINTER
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/SPLINTER/
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Bioconductor

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