SPIA

DOI:10.18129 / B9.bioc.SPIA

这个包是3.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅SPIA。

信号通路影响分析(SPIA)使用途径代表的证据和不寻常的信号干扰

Bioconductor版本:3.12

这个包实现了信号通路影响分析(SPIA)使用差异表达基因的信息形成一个列表和他们的日志褶皱与信号通路的拓扑变化,为了识别途径最相关条件下的研究。

作者:Adi Laurentiu Tarca < atarca med.wayne.edu >, Purvesh Kathri < Purvesh cs.wayne.edu >和索林Draghici <索林wayne.edu >

维护人员:Adi Laurentiu Tarca < atarca med.wayne.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“SPIA”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“SPIA”)

PDF	R脚本	SPIA
PDF		参考手册
文本		许可证

细节

biocViews	GraphAndNetwork,微阵列,软件
版本	2.42.0
Bioconductor自	BioC 2.4 (r - 2.9)(12年)
许可证	文件许可证
取决于	R(> = 2.14.0),图形,KEGGgraph
进口	图形
链接
建议	图,Rgraphviz,hgu133plus2.db
SystemRequirements
增强了
URL	http://bioinformatics.oxfordjournals.org/cgi/reprint/btn577v1
取决于我
进口我	EnrichmentBrowser
建议我	石墨,KEGGgraph
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	SPIA_2.42.0.tar.gz
Windows二进制	SPIA_2.42.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	SPIA_2.42.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SPIA
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ SPIA
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/SPIA/
包下载报告	下载数据