Smad

doi:10.18129/b9.bioc.smad

该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅Smad

AP-MS数据(SMAD)的统计建模

生物导体版本:3.12

将概率得分分配给在亲和力纯化质谱法(AP-MS)中捕获的猎物蛋白,以推断蛋白质 - 蛋白质相互作用。该输出将促进非特异性背景去除,因为在AP-MS数据中通常发现污染物。

作者:青木张[AUT,CRE]

维护者:Qingzhou Zhang

引用(从r内,输入引用(“ smad”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ smad”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Smad”)

html R脚本 SMAD快速开始
PDF 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

生物浏览 质谱,,,,蛋白质组学,,,,软件
版本 1.6.0
在生物导体中 Bioc 3.9(R-3.6)(2年)
执照 麻省理工学院 +文件执照
要看 r(> = 3.6.0),rcppalgos
进口 马格里特(> = 1.5),dplyr,统计花花公子,utils,RCPP(> = 1.0.0)
链接 RCPP
建议 尼特,,,,rmarkDown,,,,测试,,,,生物使用
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 smad_1.6.0.tar.gz
Windows二进制 smad_1.6.0.zip(32-和64位)
MacOS 10.13(高山脉) smad_1.6.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/smad
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/smad
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/smad/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • 正常词 邮件列表 - 包装开发人员bob电竞体育官网