SIMAT

DOI:10.18129 / B9.bioc.SIMAT

这个包是3.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅SIMAT。

GC-SIM-MS数据处理和alaysis工具

Bioconductor版本:3.12

这个包提供了一个分析的管道在gc - ms数据选择离子监测模式(SIM)。该工具还提供了一个指导在选择合适的碎片感兴趣的目标通过使用一个优化算法。这是通过考虑重叠峰从图书馆由用户提供。

作者:m . r . Nezami Ranjbar < nranjbar vt.edu >

维护人员:m . r . Nezami Ranjbar < nranjbar vt.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“SIMAT”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“SIMAT”)

PDF	R脚本	SIMAT用法
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ImmunoOncology,MassSpectrometry,代谢组学,软件
版本	1.22.0
Bioconductor自	BioC 3.1 (r - 3.2)(6年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 3.5.0),Rcpp(> = 0.11.3)
进口	mzR,ggplot2、网格reshape2,统计grDevices跑龙套
链接
建议	RUnit,BiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL	http://omics.georgetown.edu/SIMAT.html
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	SIMAT_1.22.0.tar.gz
Windows二进制	SIMAT_1.22.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	SIMAT_1.22.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SIMAT
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ SIMAT
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/SIMAT/
包下载报告	下载数据