该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅setools。
生物导体版本:3.12
这包括一组用于使用SummarizedExperiment类的工具,包括合并,熔化,聚合和绘图功能。特别是,Setools提供了一个简单的接口,用于绘制SE对象的复杂热图。
作者:Pierre-Luc Germain [CRE,AUT]
维护者:Pierre-Luc Germain
引用(从r内,输入引用(“ setools”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ setools”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ setools”)
html | R脚本 | setools |
参考手册 |
生物浏览 | 基因表达,,,,软件,,,,可视化 |
版本 | 1.4.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.10(R-3.6)(1。5年) |
执照 | GPL |
要看 | R(> = 4.0) |
进口 | S4VECTORS,,,,总结性特征,,,,Data.Table,,,,pheatmap,,,,串行,,,,复杂的图像,,,,循环, 方法,生物比较,,,,Randomcolor,,,,EDGER,,,,OpenXLSX |
链接 | |
建议 | 生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,GGPLOT2 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
BugReports | https://github.com/plger/setools |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | setools_1.4.0.tar.gz |
Windows二进制 | setools_1.4.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | setools_1.4.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/setools |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/setools |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/setools/ |
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