setools

doi:10.18129/b9.bioc.setools

该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅setools

setools:用于使用Summariedexperiment的工具

生物导体版本:3.12

这包括一组用于使用SummarizedExperiment类的工具,包括合并,熔化,聚合和绘图功能。特别是,Setools提供了一个简单的接口,用于绘制SE对象的复杂热图。

作者:Pierre-Luc Germain [CRE,AUT]

维护者:Pierre-Luc Germain

引用(从r内,输入引用(“ setools”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ setools”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ setools”)

html R脚本 setools
PDF 参考手册

细节

生物浏览 基因表达,,,,软件,,,,可视化
版本 1.4.0
在生物导体中 Bioc 3.10(R-3.6)(1。5年)
执照 GPL
要看 R(> = 4.0)
进口 S4VECTORS,,,,总结性特征,,,,Data.Table,,,,pheatmap,,,,串行,,,,复杂的图像,,,,循环, 方法,生物比较,,,,Randomcolor,,,,EDGER,,,,OpenXLSX
链接
建议 生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,GGPLOT2
系统要求
增强
URL
BugReports https://github.com/plger/setools
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 setools_1.4.0.tar.gz
Windows二进制 setools_1.4.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) setools_1.4.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/setools
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/setools
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/setools/
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