sbgnview
doi：10.18129/b9.bioc.sbgnview
该包适用于生物导体的3.12版；对于稳定的最新版本，请参阅sbgnview。
“ SBGNVIEW：SBGN途径上的数据分析，集成和可视化”
生物导体版本：3.12
SBGNView是用于基于途径的数据视觉化，集成和分析的工具集。SBGNView与广泛使用的PathView相似，具有以下关键特征：1。通过广泛采用的系统生物学图形符号（SBGN）的途径定义；2.支持KEGG（Reactome，Metacyc，SMPDB，Panther，Metacrop）和用户定义的途径以外的多个主要途径数据库；3.覆盖5,200条参考途径，默认情况下有3,000多种；4.广泛的图形控件，包括字形和边缘属性，图形布局和子路径亮点；5. SBGN途径数据操作，处理，提取和分析。
作者：Xiaoxi Dong*，Kovidh Vegesna*，Weijun Luo
维护者：weijun luo
引用（从r内，输入引用（“ sbgnview”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ sbgnview”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ sbgnview”）
| html | R脚本 | 使用SBGNVIEW基因集的途径分析 |
| html | R脚本 | 快速启动SBGNVIEW |
| html | R脚本 | sbgnview函数 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 差异性，，，，基因表达，，，，基因烯，，，，遗传学，，，，遗传学，，，，GraphandNetwork，，，，代谢组学，，，，微阵列，，，，途径，，，，蛋白质组学，，，，rnaseq，，，，测序，，，，软件，，，，系统生物学，，，，可视化 |
| 版本 | 1.4.1 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.10（R-3.6）（1。5年） |
| 执照 | AGPL-3 |
| 要看 | r（> = 3.6），PathView，，，，sbgnview.data |
| 进口 | rdpack，grdevices，方法，统计，utils，XML2，，，，RSVG，，，，Igraph，，，，rmarkDown，，，，尼特，，，，总结性特征，，，，AnnotationDbi，，，，httr，，，，keggrest，，，，预订 |
| 链接 | |
| 建议 | 测试，，，，量规 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/datapplab/sbgnview |
| BugReports | https://github.com/datapplab/sbgnview/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | sbgnview_1.4.1.tar.gz |
| Windows二进制 | sbgnview_1.4.1.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | sbgnview_1.4.1.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/sbgnview |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/sbgnview |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/sbgnview/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
