稀有
doi：10.18129/b9.bioc.rariant
此软件包适用于生物导体的3.12版。该软件包已从生物导体中删除。有关最后一个稳定的最新版本版本，请参阅稀有。
通过非共识基本呼叫频率的变化来识别和评估单核苷酸变体
生物导体版本：3.12
“稀有”软件包根据匹配样品之间的双元分布的不匹配速率的差异从测序数据中识别单核苷酸变体。
作者：朱利安·盖林（Julian Gehring），西蒙·安德斯（Simon Anders），伯恩德·克劳斯（Bernd Klaus）
维护者：julian gehring
引用（从r内，输入引用（“稀有”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ rariant”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“稀有”）
| html | R脚本 | 稀有 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 基因组变量，，，，测序，，，，软件，，，，somaticmmut，，，，统计信息，，，，变体挖出，，，，可视化 |
| 版本 | 1.25.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.14（R-3.1）（7年） |
| 执照 | GPL-3 |
| 要看 | r（> = 3.0.2），基因组机，，，，变体 |
| 进口 | 方法，生物基因，，，，S4VECTORS，，，，iranges，，，，GenomeInfodB，，，，GGBIO，，，，GGPLOT2，，，，外观复制，，，，躯体签名，，，，rsamtools，，，，闪亮的，，，，VGAM，，，，dplyr，，，，RESHAPE2 |
| 链接 | |
| 建议 | H5VCDATA，，，，测试，，，，尼特，，，，Optparse，，，，bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/juliangehring/rariant |
| BugReports | https://support.bioconductor.org |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | rariant_1.25.0.tar.gz |
| Windows二进制 | rariant_1.25.0.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | rariant_1.25.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rariant |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：包装/稀有 |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/rariant/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
