该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅RVS。
生物导体版本:3.12
罕见的变体共享(RVS)实现了稀有遗传变异基因型与二分法表型之间的关联测试和连接的测试,例如疾病状况,在家庭样本中。这些测试基于亲戚在零假设中稀有变体共享的概率,该假设缺乏稀有变体与表型之间没有链接和关联的概率,并适用于一个区域中的单个变体或多个变体(例如,基于基因的测试)。
作者:亚历山德尔局,Ingo Ruczinski,Samuel Younkin,Thomas Sherman
维护者:thomas Sherman
引用(从r内,输入引用(“ RVS”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ rvs”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ RVS”)
html | R脚本 | RVS软件包 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | Exomeseq,,,,遗传学,,,,Genomewideassociation,,,,免疫学,,,,软件,,,,变体挖出,,,,全媒体 |
版本 | 1.12.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.6(R-3.4)(3.5岁) |
执照 | GPL-2 |
要看 | R(> = 3.5.0) |
进口 | Genlib,,,,粮食,,,,snpstats,,,,亲属2,方法,统计,utils |
链接 | |
建议 | 尼特,,,,测试,,,,rmarkDown,,,,生物使用,,,,变体 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | rvs_1.12.0.tar.gz |
Windows二进制 | rvs_1.12.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | rvs_1.12.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rvs |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/rvs |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/rvs/ |
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