RVS

doi:10.18129/b9.bioc.rvs

该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅RVS

计算共享稀有变体的相关个体的概率的估计值

生物导体版本:3.12

罕见的变体共享(RVS)实现了稀有遗传变异基因型与二分法表型之间的关联测试和连接的测试,例如疾病状况,在家庭样本中。这些测试基于亲戚在零假设中稀有变体共享的概率,该假设缺乏稀有变体与表型之间没有链接和关联的概率,并适用于一个区域中的单个变体或多个变体(例如,基于基因的测试)。

作者:亚历山德尔局,Ingo Ruczinski,Samuel Younkin,Thomas Sherman

维护者:thomas Sherman

引用(从r内,输入引用(“ RVS”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ rvs”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ RVS”)

html R脚本 RVS软件包
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 Exomeseq,,,,遗传学,,,,Genomewideassociation,,,,免疫学,,,,软件,,,,变体挖出,,,,全媒体
版本 1.12.0
在生物导体中 Bioc 3.6(R-3.4)(3.5岁)
执照 GPL-2
要看 R(> = 3.5.0)
进口 Genlib,,,,粮食,,,,snpstats,,,,亲属2,方法,统计,utils
链接
建议 尼特,,,,测试,,,,rmarkDown,,,,生物使用,,,,变体
系统要求
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包装档案

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源包 rvs_1.12.0.tar.gz
Windows二进制 rvs_1.12.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) rvs_1.12.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rvs
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/rvs
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/rvs/
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