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ROSeq
DOI:10.18129 / B9.bioc.ROSeq
这个包是3.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅ROSeq。
建模表达式noise-tolerant军衔微分表达式分析scRNA-Seq数据
Bioconductor版本:3.12
ROSeq——基于秩的建模方法的基因表达与过滤和规范化阅读数矩阵。ROSeq需要过滤和规范化阅读矩阵和cell-annotation /条件作为输入,并对比组之间的差异表达基因决定了单个细胞。输入参数之一是使用内核的数量。
作者:Krishan古普塔(aut (cre) Manan Lalit (aut) Aditya Biswas (aut) Abhik Ghosh (aut) Debarka森古普塔(aut)
维护人员:Krishan Gupta < krishang在iiitd.ac.in >
从内部引用(R,回车引用(“ROSeq”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“ROSeq”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“ROSeq”)
| HTML | R脚本 | ROSeq |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 | |
| 文本 | 许可证 |
细节
| biocViews | DifferentialExpression,GeneExpression,SingleCell,软件 |
| 版本 | 1.2.10 |
| Bioconductor自 | BioC 3.11 (r - 4.0)(1年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (> = 4.0) |
| 进口 | pbmcapply,刨边机,limma |
| 链接 | |
| 建议 | knitr,rmarkdown,testthat,RUnit,BiocGenerics |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/krishan57gupta/ROSeq |
| BugReports | https://github.com/krishan57gupta/ROSeq/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | ROSeq_1.2.10.tar.gz |
| Windows二进制 | ROSeq_1.2.10.zip |
| macOS 10.13(高山脉) | ROSeq_1.2.10.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ROSeq |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ROSeq |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/ROSeq/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
