RNAinteract

DOI:10.18129 / B9.bioc.RNAinteract

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见RNAinteract．

从多维特征估计成对相互作用

Bioconductor版本:3.12

rninteraction通过从图像中提取的特征等多维读出来估计遗传相互作用。筛管假定采用多孔板或类似设计。从每个孔的特征列表(例如细胞数量、面积、荧光强度)开始，估计遗传相互作用。该软件包提供了报告相互作用基因对、绘制热图和双RNAi图的功能。可以为质量控制和分析编写HTML报告。

作者:Bernd Fischer

维护者:Bernd Fischer

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“RNAinteract”)

PDF	R脚本	RNAinteract
PDF		参考手册

细节

biocViews	CellBasedAssays，ImmunoOncology，预处理，质量控制，软件，可视化
版本	1.38.0
在Bioconductor	BioC 2.8 (R-2.13)(10年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 2.12.0)，abind，locfit，Biobase
进口	RColorBrewer，ICS，ICSNP，cellHTS2，geneplotter，gplots、网格hwriter，晶格，latticeExtra，limma、方法、splots(> = 1.13.12)
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我	RNAinteractMAPK
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	RNAinteract_1.38.0.tar.gz
Windows二进制	RNAinteract_1.38.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	RNAinteract_1.38.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RNAinteract
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ rninteract
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/RNAinteract/
软件包下载报告	下载数据