RGMQL
doi：10.18129/b9.bioc.rgmql
该包适用于生物导体的3.12版；对于稳定的最新版本，请参阅RGMQL。
r/bioconductor的静态查询语言
生物导体版本：3.12
该软件包将GENOMETRIC查询语言（GMQL）功能带入R环境。GMQL是一种高级，声明性的语言，用于用于生物医学目的的异质基因组数据集，使用简单的查询来处理基因组区域及其元数据和属性。GMQL使用云计算技术（如Apache Hadoop和Spark）有效地采用了为大数据设计的算法，从而使GMQL能够在现代基础架构上运行，以实现可扩展性和高性能。它允许从本地和遥远的不同数据源创建，操纵和提取基因组数据。我们的RGMQL函数允许在r惯用范式上利用复杂的查询和处理。RGMQL软件包还提供了一组丰富的辅助类，可允许复杂的输入/输出管理和排序，例如：ASC，DESC，BAG，MIN，MAX，MAX，SUM，AVG，中位数，STD，Q1，Q1，Q2，Q3（以及许多）其他）。请注意，许多RGMQL函数并非在R环境中直接执行，而是在发出真实执行之前被推迟。
作者：Simone Pallotta，Marco Masseroli
维护者：Simone Pallotta
引用（从r内，输入引用（“ RGMQL”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ rgmql”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ rgmql”）
| R脚本 | RGMQL：r/bioconductor的GENOMETRIC查询语言 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | DataImport，，，，免疫学，，，，基础设施，，，，网络，，，，Singlecell，，，，软件 |
| 版本 | 1.10.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.7（R-3.5）（3年） |
| 执照 | 艺术2.0 |
| 要看 | r（> = 3.4.2），rgmqllib |
| 进口 | httr，，，，rjava，，，，基因组机，，，，rtracklayer，，，，Data.Table，utils，plyr，，，，XML2， 方法，S4VECTORS，，，，dplyr，统计胶水，，，，生物基因 |
| 链接 | |
| 建议 | 生物使用，，，，尼特，，，，rmarkDown |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | http://www.bioinformatics.deib.polimi.it/genomic_computing/gmql/ |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | rgmql_1.10.0.tar.gz |
| Windows二进制 | RGMQL_1.10.0.ZIP |
| MacOS 10.13（高山脉） | |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rgmql |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/rgmql |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/rgmql/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
