Polyfit

DOI:10.18129 / B9.bioc.Polyfit

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见Polyfit．

添加到DESeq，以提高p值和q值

Bioconductor版本:3.12

Polyfit是包DESeq的一个附加组件，它确保p值在区间[0,1]上的分布是均匀的，对于满足无差分表达式的零假设的数据，并使用一种适应的story - tibshiran方法来计算q值。

作者:康拉德·伯顿

维护者:Conrad Burden < Conrad。负担在anu.edu.au>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("Polyfit")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“Polyfit”)

PDF	R脚本	Polyfit
PDF		参考手册

细节

biocViews	DifferentialExpression，GeneExpression，ImmunoOncology，RNASeq，测序，软件
版本	1.24.0
在Bioconductor	BioC 3.0 (R-3.1)(6.5年)
许可证	GPL (>= 3)
取决于	DESeq
进口
链接
建议	BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	Polyfit_1.24.0.tar.gz
Windows二进制	Polyfit_1.24.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	Polyfit_1.24.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Polyfit
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/Polyfit
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/Polyfit/
软件包下载报告	下载数据