PeacoQC

DOI:10.18129 / B9.bioc.PeacoQC

这个包是3.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅PeacoQC

Peak-based选择高质量的血细胞计数数据

Bioconductor版本:3.12

这是一个包,包括预处理和质量控制功能,可以消除边缘事件,补偿和转换数据,将使用PeacoQCSignalStability质量控制。最后一个函数将首先检测峰值flowframe每个通道的。它将删除异常基于IsolationTree函数和疯狂的孤立点检测方法。这个包可以用于质量流和血细胞计数数据。

作者:Annelies Emmaneel (aut (cre)

维护人员:Annelies Emmaneel < Annelies。在hotmail.com emmaneel >

从内部引用(R,回车引用(“PeacoQC”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“PeacoQC”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“PeacoQC”)

HTML R脚本 PeacoQC_Vignette
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews FlowCytometry,PeakDetection,预处理,质量控制,软件
版本 0.99.25
Bioconductor自 BioC 3.12 (r - 4.0)(0.5年)
许可证 GPL (> = 3)
取决于 R (> = 4.0)
进口 circlize,ComplexHeatmap,flowCore,flowWorkspace,ggplot2、grDevices、网格gridExtra、方法、plyr统计,跑龙套
链接
建议 knitr,rmarkdown,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL http://github.com/saeyslab/PeacoQC
BugReports http://github.com/saeyslab/PeacoQC/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 PeacoQC_0.99.25.tar.gz
Windows二进制 PeacoQC_0.99.25.zip
macOS 10.13(高山脉) PeacoQC_0.99.25.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/PeacoQC
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ PeacoQC
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/PeacoQC/
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