此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见PanVizGenerator.
Bioconductor版本:3.12
PanViz是一个基于JavaScript的泛基因组功能注释可视化工具。PanVizGenerator是PanViz的伙伴,它促进了创建工作PanViz可视化所需的必要数据预处理步骤。输出是完全独立的,因此可视化的接收者不需要安装R或PanVizGenerator。
作者:Thomas Lin Pedersen
维护者:Thomas Lin Pedersen
引文(从R内,输入引用(“PanVizGenerator”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“PanVizGenerator”)
超文本标记语言 | R脚本 | 使用PanVizGenerator创建PanViz可视化 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | ComparativeGenomics,GUI,软件,可视化 |
版本 | 1.18.0 |
在Bioconductor | BioC 3.3 (R-3.3)(5年) |
许可证 | GPL (>= 2) |
取决于 | 方法 |
进口 | 闪亮的、工具、jsonlite,pcaMethods,FindMyFriends,igraph,统计,效用 |
链接 | |
建议 | BiocStyle,knitr,rmarkdown,testthat,消化 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/thomasp85/PanVizGenerator |
BugReports | https://github.com/thomasp85/PanVizGenerator/issues |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | PanVizGenerator_1.18.0.tar.gz |
Windows二进制 | PanVizGenerator_1.18.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | PanVizGenerator_1.18.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/PanVizGenerator |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/PanVizGenerator |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/PanVizGenerator/ |
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