PGSEA

DOI:10.18129 / B9.bioc.PGSEA

这个包是弃用。它可能会从Bioconductor删除。请参考包临终的指导方针为更多的信息。

这个包是Bioconductor的3.12版本。这个包已经从Bioconductor删除。最后稳定,最新的发布版本,请参阅PGSEA。

参数基因集富集分析

Bioconductor版本:3.12

参数分析的基因集富集

作者:凯尔Furge <凯尔。furge vai.org >和卡尔Dykema <卡尔。在vai.org dykema >

维护人员:卡尔Dykema <卡尔。在vai.org dykema >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“PGSEA”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	微阵列,软件
版本	1.64.0
Bioconductor自	BioC 2.0 (r - 2.5)(14年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 2.10),GO.db,KEGG.db,AnnotationDbi,annaffy、方法、Biobase(> = 2.5.5)
进口
链接
建议	GSEABase,GEOquery,org.Hs.eg.db,hgu95av2.db,limma
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	GeneExpressionSignature
进口我
建议我	gskb
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包
Windows二进制
macOS 10.13(高山脉)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/PGSEA
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ PGSEA
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/PGSEA/
包下载报告	下载数据