PGSEA

DOI:10.18129 / B9.bioc.PGSEA

这个包是弃用。它可能会从Bioconductor删除。请参考包临终的指导方针为更多的信息。

这个包是Bioconductor的3.12版本。这个包已经从Bioconductor删除。最后稳定,最新的发布版本,请参阅PGSEA

参数基因集富集分析

Bioconductor版本:3.12

参数分析的基因集富集

作者:凯尔Furge <凯尔。furge vai.org >和卡尔Dykema <卡尔。在vai.org dykema >

维护人员:卡尔Dykema <卡尔。在vai.org dykema >

从内部引用(R,回车引用(“PGSEA”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“PGSEA”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

PDF 参考手册

细节

biocViews 微阵列,软件
版本 1.64.0
Bioconductor自 BioC 2.0 (r - 2.5)(14年)
许可证 GPL-2
取决于 R (> = 2.10),GO.db,KEGG.db,AnnotationDbi,annaffy、方法、Biobase(> = 2.5.5)
进口
链接
建议 GSEABase,GEOquery,org.Hs.eg.db,hgu95av2.db,limma
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我 GeneExpressionSignature
进口我
建议我 gskb
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包
Windows二进制
macOS 10.13(高山脉)
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/PGSEA
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ PGSEA
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/PGSEA/
包下载报告 下载数据

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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网