PADOG

DOI:10.18129 / B9.bioc.PADOG

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见PADOG

降低重叠基因权重的途径分析(PADOG)

Bioconductor版本:3.12

这个包实现了一种通用的基因集分析方法,称为PADOG,它淡化了在要分析的基因集中经常出现的基因的重要性。该软件包还提供了基因集分析方法的敏感性和排名基准,使用KEGGdzPathwaysGEO软件包中的24个公共数据集。

作者:Adi Laurentiu Tarca ;徐仲辉<仲辉。徐在gmail.com>

维护者:Adi Laurentiu Tarca

引文(从R内,输入引用(“PADOG”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("PADOG")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“PADOG”)

PDF R脚本 PADOG
PDF 参考手册

细节

biocViews 微阵列OneChannel软件TwoChannel
版本 1.32.0
在Bioconductor BioC 2.11 (R-2.15)(8.5年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于 R (>= 3.0.0),KEGGdzPathwaysGEO、方法、Biobase
进口 limmaAnnotationDbiGSAforeachdoRNGhgu133plus2.dbhgu133a.dbKEGGRESTnlme
链接
建议 doParallel、并行
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我 BLMA
进口我 EGSEA
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 PADOG_1.32.0.tar.gz
Windows二进制 PADOG_1.32.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) PADOG_1.32.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/PADOG
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/PADOG
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/PADOG/
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  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网