OSAT

DOI:10.18129 / B9.bioc.OSAT

这个包是3.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅OSAT。

OSAT:最优样本分配的工具

Bioconductor版本:3.12

相当大的基因组学研究,如微阵列通常包括使用多个批次实验(集团)由于实际的并发症。批处理的影响降到最低,仔细实验设计应该保证均匀分布的生物组织和各批次的混杂因素。OSAT(最优样本分配工具)是为了便于收集样品的分配到不同的批次。用最小的步骤,它产生的设置,优化样品的均匀分布在生物兴趣分组到不同的批次,减少混淆或感兴趣的批次和生物变量之间的相关性。它甚至还可以优化分配各批次的混杂因素。我们的工具可以处理具有挑战性的情况不完整和不平衡样本集合RCBD以及理想的平衡。OSAT提供了一些预定义布局的一些最常用的基因组平台。可以在http://www.biomedcentral.com/1471-2164/13/689找到相关论文。

作者:李岩

维护人员:李岩<李。燕在roswellpark.org >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“OSAT”)

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文档

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PDF	R脚本	介绍OSAT
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataRepresentation,ExperimentalDesign,质量控制,软件,可视化
版本	1.38.0
Bioconductor自	BioC 2.11 (r - 2.15)(8.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	方法,统计数据
进口
链接
建议	xtable,Biobase
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.biomedcentral.com/1471-2164/13/689
取决于我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	OSAT_1.38.0.tar.gz
Windows二进制	OSAT_1.38.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	OSAT_1.38.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/OSAT
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ OSAT
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/OSAT/
包下载报告	下载数据