NanoStringDiff

DOI:10.18129 / B9.bioc.NanoStringDiff

这个包是3.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅NanoStringDiff。

微分表达式分析NanoString nCounter数据

Bioconductor版本:3.12

这个包利用广义线性模型(GLM)负二项家族的描述统计数据和允许多因素设计。NanoStrongDiff合并规模因素,计算出积极的控制和管理控制,和背景水平,从消极的控制,获得的模型框架,使所有提供的标准化信息NanoString nCounter分析仪是充分的利用。

作者:香港王<香港。王在uky.edu >,tingting zhai , chi wang

维护人员:婷婷翟<婷婷。翟隽在uky.edu >,香港王<香港。王在uky.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“NanoStringDiff”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“NanoStringDiff”)

PDF	R脚本	NanoStringDiff装饰图案
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialExpression,归一化,软件
版本	1.20.0
Bioconductor自	BioC 3.2 (r - 3.2)(5.5年)
许可证	GPL
取决于	Biobase
进口	matrixStats、方法、Rcpp
链接	Rcpp
建议	testthat,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	NanoStringDiff_1.20.0.tar.gz
Windows二进制	NanoStringDiff_1.20.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13(高山脉)	NanoStringDiff_1.20.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/NanoStringDiff
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ NanoStringDiff
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/NanoStringDiff/
包下载报告	下载数据