NOISeq

DOI:10.18129 / B9.bioc.NOISeq

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见NOISeq

RNA-seq数据的探索性分析和差异表达

Bioconductor版本:3.12

RNA-seq表达数据或其他类似数据的分析。用于评估饱和度、计数分布、每个染色体的表达、检测特征的类型、特征长度等的探索性图。没有参数假设的两种实验条件之间的微分表达式。

作者:Sonia Tarazona, Pedro Furio-Tari, Maria Jose Nueda, Alberto Ferrer和Ana Conesa

维护者:Sonia Tarazona

引文(从R内,输入引用(“NOISeq”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("NOISeq")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“NOISeq”)

PDF R脚本 NOISeq用户指南
PDF QCreport.pdf
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DifferentialExpressionImmunoOncologyRNASeq测序软件可视化
版本 2.34.0
在Bioconductor BioC 2.11 (R-2.15)(8.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R(>= 2.13.0),方法,Biobase(>= 2.13.11),样条(>= 3.0.1),矩阵(> = 1.2)
进口
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我 metaSeq
进口我 CNVPanelizermetaseqR
建议我 compcodeR
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 NOISeq_2.34.0.tar.gz
Windows二进制 NOISeq_2.34.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) NOISeq_2.34.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/NOISeq
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/NOISeq
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/NOISeq/
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