NCIgraph

DOI:10.18129 / B9.bioc.NCIgraph

这个包是3.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅NCIgraph

从数据库NCI通路途径

Bioconductor版本:3.12

提供了各种方法来加载路径从NCI通路数据库在R图对象和需要格式化您所需要。

作者:洛朗•雅各布

维护人员:Laurent雅各<劳伦。雅各在gmail.com >

从内部引用(R,回车引用(“NCIgraph”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“NCIgraph”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“NCIgraph”)

PDF R脚本 NCIgraph: NCI通路的网络集成数据库作为graphNEL对象。
PDF 参考手册

细节

biocViews GraphAndNetwork,通路,软件
版本 1.38.0
Bioconductor自 BioC 2.8 (r - 2.13)(10年)
许可证 GPL-3
取决于 R (> = 2.10.0)
进口 ,KEGGgraph、方法、RBGL,RCy3,R.methodsS3
链接
建议 Rgraphviz
SystemRequirements
增强了 DEGraph
URL
取决于我
进口我 DEGraph
建议我 DEGraph
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 NCIgraph_1.38.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13(高山脉)
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/NCIgraph
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ NCIgraph
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/NCIgraph/
包下载报告 下载数据

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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网