NCIgraph

DOI:10.18129 / B9.bioc.NCIgraph

这个包是3.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅NCIgraph。

从数据库NCI通路途径

Bioconductor版本:3.12

提供了各种方法来加载路径从NCI通路数据库在R图对象和需要格式化您所需要。

作者:洛朗•雅各布

维护人员:Laurent雅各<劳伦。雅各在gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“NCIgraph”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“NCIgraph”)

PDF	R脚本	NCIgraph: NCI通路的网络集成数据库作为graphNEL对象。
PDF		参考手册

细节

biocViews	GraphAndNetwork,通路,软件
版本	1.38.0
Bioconductor自	BioC 2.8 (r - 2.13)(10年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 2.10.0)
进口	图,KEGGgraph、方法、RBGL,RCy3,R.methodsS3
链接
建议	Rgraphviz
SystemRequirements
增强了	DEGraph
URL
取决于我
进口我	DEGraph
建议我	DEGraph
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	NCIgraph_1.38.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13(高山脉)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/NCIgraph
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ NCIgraph
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/NCIgraph/
包下载报告	下载数据