NBSplice

DOI:10.18129 / B9.bioc.NBSplice

这个包是3.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅NBSplice。

负二项模型检测微分拼接

Bioconductor版本:3.12

方案提出了一种微分拼接基于同种型量化评价方法。应用广义线性模型与负二项分布来推断同种型相对表达的变化。

作者:加芙美利奴和埃尔默a·费尔南德斯

维护人员:加芙美利奴<美利奴。在gmail.com gabriela33 >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“NBSplice”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“NBSplice”)

HTML	R脚本	NBSplice-vignette
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	AlternativeSplicing,DifferentialExpression,DifferentialSplicing,ImmunoOncology,RNASeq,回归,软件,StatisticalMethod
版本	1.8.0
Bioconductor自	BioC 3.8 (r - 3.5)(2.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R(> = 3.5),方法
进口	刨边机统计数据,质量,车,mppa,BiocParallel,ggplot2,reshape2
链接
建议	knitr,RUnit,BiocGenerics,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.bdmg.com.ar
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	NBSplice_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	NBSplice_1.8.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	NBSplice_1.8.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/NBSplice
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ NBSplice
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/NBSplice/
包下载报告	下载数据