NBAMSeq

DOI:10.18129 / B9.bioc.NBAMSeq

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见NBAMSeq．

RNA-Seq数据的负二项式加性模型

Bioconductor版本:3.12

高通量测序实验和差异表达分析是一种广泛应用的检测基因组生物标志物的方法。差异表达分析的一个基本步骤是建立基因计数和相关协变量之间的关联模型。NBAMSeq是一种基于广义可加性模型的灵活统计模型，允许在方差估计中跨基因共享信息。

作者:徐仁[aut, cre]，裴芬宽[aut]

维护人员:徐仁

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("NBAMSeq")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

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browseVignettes(“NBAMSeq”)

超文本标记语言	R脚本	RNA-Seq数据的负二项式加性模型
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文本		新闻

细节

biocViews	报道，DifferentialExpression，GeneExpression，RNASeq，测序，软件
版本	1.6.1
在Bioconductor	BioC 3.9 (R-3.6)(2年)
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 3.6)，SummarizedExperiment，S4Vectors
进口	DESeq2，mgcv-24年(> = 1.8),BiocParallel，genefilter、方法、统计
链接
建议	knitr，rmarkdown，testthat，ggplot2
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/reese3928/NBAMSeq
BugReports	https://github.com/reese3928/NBAMSeq/issues
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进口我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	NBAMSeq_1.6.1.tar.gz
Windows二进制	NBAMSeq_1.6.1.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	NBAMSeq_1.6.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/NBAMSeq
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/NBAMSeq
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/NBAMSeq/
软件包下载报告	下载数据