MultiBaC

DOI:10.18129 / B9.bioc.MultiBaC

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见MultiBaC

多组批效应校正

Bioconductor版本:3.12

MultiBaC是一种纠正来自分布在不同实验室或数据采集事件的多组数据集的批处理效应的策略。MultiBaC是第一个处理多组数据集批量效应校正的批量效应校正算法。MultiBaC能够删除在单独批次中生成的不同组学之间的批效应,前提是所有考虑的批次中至少包括一种常见组学数据类型。

作者:person(“Manuel”,“Ugidos”,email =“manuelugidos@gmail.com”),person(“Sonia”,“Tarazona”,email =“sotacam@gmail.com”),person(“María José”,“Nueda”,email =“mjnueda@ua.es”)

维护者:包维护者

引文(从R内,输入引用(“MultiBaC”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("MultiBaC")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“MultiBaC”)

超文本标记语言 R脚本 MultiBaC
PDF 参考手册

细节

biocViews BatchEffectDataRepresentationGeneExpressionPrincipalComponent软件StatisticalMethod转录
版本 1.0.0
在Bioconductor BioC 3.12 (R-4.0)(0.5年)
许可证 GPL-3
取决于
进口 矩阵ggplot2MultiAssayExperimentropls、图形、方法
链接
建议 knitrrmarkdownBiocStyledevtools
SystemRequirements
增强了
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包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 MultiBaC_1.0.0.tar.gz
Windows二进制 MultiBaC_1.0.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) MultiBaC_1.0.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MultiBaC
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/MultiBaC
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/MultiBaC/
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