MotIV

DOI:10.18129 / B9.bioc.MotIV

这个包裹是弃用．它可能会从Bioconductor中移除。详情请参阅包装寿命终止指南获取更多信息。

此包适用于Bioconductor 3.12版。此包已从Bioconductor中删除。有关最新的稳定发布版本，请参见MotIV．

母题识别与验证

Bioconductor版本:3.12

这个包使用STAMP将一组图案与给定的数据库(例如JASPAR)进行比较。它也可以用来可视化图案，图案分布，模块和过滤器图案。

作者:Eloi Mercier, Raphael Gottardo

维护者:Eloi Mercier < bcgsc的Mercier。ca>， Raphael Gottardo

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("MotIV")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	ChIPSeq，ChIPchip，GenomicSequence，微阵列，MotifAnnotation，软件
版本	1.46.0
在Bioconductor	BioC 2.6 (R-2.11)(11年)
许可证	GPL-2
取决于	R(>= 2.10)，图形，BiocGenerics，GenomicRanges
进口	方法，统计，网格，S4Vectors，IRanges(> = 1.13.5),Biostrings，晶格，rGADEM,跑龙套
链接
建议	rtracklayer
SystemRequirements	GNU科学图书馆>= 1.6 (http://www.gnu.org/software/gsl/)
增强了
URL
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进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MotIV
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/MotIV
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MotIV/
软件包下载报告	下载数据