甲基化
doi：10.18129/b9.bioc.methylaid
该包适用于生物导体的3.12版；对于稳定的最新版本，请参阅甲基化。
大型Illumina DNA甲基化阵列数据集的视觉和交互式质量控制
生物导体版本：3.12
使用Rstudio的闪亮软件包的视觉和交互式Web应用程序。使用阵列和用户可调阈值中存在的样品依赖性和独立的对照来检测到不良质量样本。可以使用阵列中存在的质量控制探针的几个交互式诊断图对不良质量样本进行深入探索。此外，可以探索用户提供的任何批处理效果的影响。
作者：Maarten van Iterson [AUT，CRE]，Elmar Tobi [CTB]，Roderick Slieker [CTB]，Wouter Den Hollander [CTB]，Rene Luijk [CTB]和Bas Heijmans [CTB]
维护者：l.j.sinke
引用（从r内，输入引用（“甲基化”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“甲基化”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“甲基化”）
| R脚本 | 甲基化：Illumina人DNA甲基化阵列数据的视觉和互动质量控制数据 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 批处理效应，，，，DNAMETHYLATY，，，，GUI，，，，甲基化array，，，，微阵列，，，，QualityControl，，，，软件，，，，两通道，，，，可视化 |
| 版本 | 1.24.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.0（R-3.1）（6。5年） |
| 执照 | GPL（> = 2） |
| 要看 | R（> = 3.4） |
| 进口 | 生物酶，，，，生物比较，，，，生物基因，，，，GGPLOT2， 网格，Gridbase，grdevices，图形，Hexbin，，，，矩阵，，，，Minfi（> = 1.22.0），方法，rcolorbrewer，，，，闪亮的，统计总结性特征，UTILS |
| 链接 | |
| 建议 | 生物使用，，，，尼特，，，，甲基辅助，，，，Minfidata，，，，minfidataepic，，，，运行 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | 甲基辅助 |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | Methylaid_1.24.0.tar.gz |
| Windows二进制 | 甲基因1.24.0.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | 甲基助理_1.24.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/methylaid |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：包装/甲基化 |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/methylaid/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
