MWASTools

DOI:10.18129 / B9.bioc.MWASTools

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见MWASTools

MWASTools:执行代谢组范围关联研究的集成管道

Bioconductor版本:3.12

MWASTools提供了一个完整的管道来执行代谢组范围的关联研究。该软件包的主要功能包括:代谢组学数据的质量控制分析;MWAS使用不同的关联模型(部分相关;广义线性模型);非参数自举法模型验证MWAS结果可视化;核磁共振代谢物的STOCSY鉴定MWAS结果的生物学解释。

作者:Andrea Rodriguez-Martinez, Joram M. Posma, Rafael Ayala, Ana L. Neves, Maryam Anwar, Jeremy K. Nicholson, Marc-Emmanuel Dumas

维护者:Andrea Rodriguez-Martinez < Andrea。罗德里格斯-马丁内兹13在imperial.ac。英国>,拉斐尔阿亚拉

引文(从R内,输入引用(“MWASTools”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("MWASTools")

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文档

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browseVignettes(“MWASTools”)

超文本标记语言 R脚本 MWASTools
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细节

biocViews CheminformaticsLipidomics代谢组学质量控制软件SystemsBiology
版本 1.14.0
在Bioconductor BioC 3.5 (R-3.4)(4年)
许可证 Cc by nc - nd 4.0
取决于 R (>= 3.4)
进口 glm2ppcorqvalue引导、网格ggplot2gridExtraigraphSummarizedExperimentKEGGgraphRCurlKEGGRESTComplexHeatmap,统计,效用
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源包 MWASTools_1.14.0.tar.gz
Windows二进制 MWASTools_1.14.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) MWASTools_1.14.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MWASTools
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/MWASTools
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/MWASTools/
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