MOFA

doi:10.18129/b9.bioc.mofa

这个包是弃用。它可能会从生物导体中取出。请参考包装终止指南了解更多信息。

此软件包适用于生物导体的3.12版。该软件包已从生物导体中删除。有关最后一个稳定的最新版本版本,请参阅MOFA(请参阅更换MOFA2)。

多词因素分析(MOFA)

生物导体版本:3.12

多词因素分析:用于集成多摩尼斯数据集的无监督框架。

作者:Ricard Argelaguet,Britta Velten,Damien Arnol,Florian Buettner,Wolfgang Huber,Oliver Stegle

维护者:britta velten

引用(从r内,输入引用(“ MOFA”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ mofa”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Mofa”)

html R脚本 MOFA简介
html R脚本 MOFA:应用于单细胞多摩斯数据集
html R脚本 MOFA:应用于CLL患者的多摩变数据集
html R脚本 MOFA:如何评估模型鲁棒性并进行模型选择
PDF 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

生物浏览 贝叶斯,,,,维度,,,,软件,,,,可视化
版本 1.6.2
在生物导体中 Bioc 3.9(R-3.6)(2年)
执照 LGPL-3 |文件执照
要看 R(> = 3.5)
进口 RHDF5,,,,dplyr,,,,RESHAPE2,,,,pheatmap,,,,Corrplot,,,,GGPLOT2,,,,ggbeeswarm, 方法,,,,,ggally,,,,rcolorbrewer,,,,牛仔图,,,,Ggrepel,,,,多亚sayExexperiment,,,,生物酶,,,,多帕尔,,,,foreach,,,,网状,grdevices,统计,utils
链接
建议 尼特,,,,Mofadata
系统要求 python(> = 2.7.0),numpy,pandas,h5py,scipy,sklearn,mofapy
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 mofa_1.6.2.tar.gz
Windows二进制 mofa_1.6.2.zip
MacOS 10.13(高山脉) mofa_1.6.2.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mofa
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/mofa
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/mofa/
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