这个包是弃用。它可能会从生物导体中取出。请参考包装终止指南了解更多信息。
此软件包适用于生物导体的3.12版。该软件包已从生物导体中删除。有关最后一个稳定的最新版本版本,请参阅MOFA(请参阅更换MOFA2)。
生物导体版本:3.12
多词因素分析:用于集成多摩尼斯数据集的无监督框架。
作者:Ricard Argelaguet,Britta Velten,Damien Arnol,Florian Buettner,Wolfgang Huber,Oliver Stegle
维护者:britta velten
引用(从r内,输入引用(“ MOFA”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ mofa”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Mofa”)
html | R脚本 | MOFA简介 |
html | R脚本 | MOFA:应用于单细胞多摩斯数据集 |
html | R脚本 | MOFA:应用于CLL患者的多摩变数据集 |
html | R脚本 | MOFA:如何评估模型鲁棒性并进行模型选择 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 | |
文本 | 执照 |
生物浏览 | 贝叶斯,,,,维度,,,,软件,,,,可视化 |
版本 | 1.6.2 |
在生物导体中 | Bioc 3.9(R-3.6)(2年) |
执照 | LGPL-3 |文件执照 |
要看 | R(> = 3.5) |
进口 | RHDF5,,,,dplyr,,,,RESHAPE2,,,,pheatmap,,,,Corrplot,,,,GGPLOT2,,,,ggbeeswarm, 方法,秤,,,,ggally,,,,rcolorbrewer,,,,牛仔图,,,,Ggrepel,,,,多亚sayExexperiment,,,,生物酶,,,,多帕尔,,,,foreach,,,,网状,grdevices,统计,utils |
链接 | |
建议 | 尼特,,,,Mofadata |
系统要求 | python(> = 2.7.0),numpy,pandas,h5py,scipy,sklearn,mofapy |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | mofa_1.6.2.tar.gz |
Windows二进制 | mofa_1.6.2.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | mofa_1.6.2.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mofa |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/mofa |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/mofa/ |
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