LowMACA

DOI:10.18129 / B9.bioc.LowMACA

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见LowMACA．

LowMACA -通过一致性比对的低频突变分析

Bioconductor版本:3.12

LowMACA包是一套简单的工具，通过一致性对齐来调查和分析几种蛋白质或pfam结构域的突变谱。您可以使用我们的软件包进行假设驱动的探索性分析，只需提供一组您感兴趣的基因或pfam域。

作者:Stefano de Pretis, Giorgio Melloni

维护者:Stefano de Pretis ， Giorgio Melloni < Melloni。乔治在gmail.com>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“LowMACA”)

超文本标记语言	R脚本	HTML文档的Bioconductor样式
PDF		参考手册
文本		自述
文本		新闻

细节

biocViews	对齐，DataImport，MultipleSequenceAlignment，SequenceMatching，测序，软件，SomaticMutation，WholeGenome
版本	1.20.0
在Bioconductor	BioC 3.1 (R-3.2)(6年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 2.10)
进口	cgdsr平行,stringr，reshape2，data.table，RColorBrewer、方法、LowMACAAnnotation，BiocParallel，motifStack，Biostrings，httr、网格gridBase
链接
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown
SystemRequirements	Clustalo, gs, perl
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	LowMACA_1.20.0.tar.gz
Windows二进制	LowMACA_1.20.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	LowMACA_1.20.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/LowMACA
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/LowMACA
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/LowMACA/
软件包下载报告	下载数据