LoomExperiment

DOI:10.18129 / B9.bioc.LoomExperiment

这个包是3.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅LoomExperiment。

LoomExperiment容器

Bioconductor版本:3.12

LoomExperiment类提供了一种方便地转换Bioconductor织机的“实验”类文件,反之亦然。

作者:丹尼尔·Twisk马丁•摩根

维修工:Bioconductor包维护者<维护者bioconductor.org >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“LoomExperiment”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“LoomExperiment”)

HTML	R脚本	介绍LoomExperiment类
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport,DataRepresentation,ImmunoOncology,基础设施,SingleCell,软件
版本	1.8.0
Bioconductor自	BioC 3.8 (r - 3.5)(2.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.5.0),S4Vectors,SingleCellExperiment,SummarizedExperiment、方法、rhdf5,rtracklayer
进口	DelayedArray,GenomicRanges,HDF5Array,矩阵统计数据,stringr,跑龙套
链接
建议	testthat,BiocStyle,knitr,网状
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我	HCAExplorer
建议我	HCAMatrixBrowser
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	LoomExperiment_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	LoomExperiment_1.8.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	LoomExperiment_1.8.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/LoomExperiment
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ LoomExperiment
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/LoomExperiment/
包下载报告	下载数据