萝拉

DOI:10.18129 / B9.bioc.LOLA

这个包是3.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅萝拉

轨迹重叠分析基因组范围的浓缩

Bioconductor版本:3.12

提供功能测试集重叠的基因组区域与公众和自定义区域设置(基因组范围)数据库。这个可以做自动浓缩分析基因组区域集,从而促进的解释功能基因组和表观基因组学数据。

作者:内森谢菲尔德< http://www.databio.org > (aut (cre) Christoph烈性黑啤酒(施)

维修工:内森谢菲尔德内森< code.databio.org >

从内部引用(R,回车引用(“洛拉”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“洛拉”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(“洛拉”)

HTML R脚本 1。开始使用它
HTML R脚本 2。使用洛拉核心
HTML R脚本 3所示。选择一个宇宙
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews ChIPSeq,FunctionalGenomics,GeneRegulation,GeneSetEnrichment,GenomeAnnotation,MethylSeq,测序,软件,SystemsBiology
版本 1.20.0
Bioconductor自 BioC 3.2 (r - 3.2)(5.5年)
许可证 GPL-3
取决于 R (> = 2.10)
进口 BiocGenerics,S4Vectors,IRanges,GenomicRanges,data.table,reshape2跑龙套,统计方法
链接
建议 平行,testthat,knitr,BiocStyle,rmarkdown
SystemRequirements
增强了 simpleCache,qvalue,ggplot2
URL http://code.databio.org/LOLA
BugReports http://github.com/nsheff/LOLA
取决于我
进口我
建议我 可可,位深蓝,米拉
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 LOLA_1.20.0.tar.gz
Windows二进制 LOLA_1.20.0.zip
macOS 10.13(高山脉) LOLA_1.20.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/LOLA
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/洛拉
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/LOLA/
包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请阅读发布指南。文章质疑Bioconductor到以下位置:

  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网