萝拉
DOI:10.18129 / B9.bioc.LOLA
这个包是3.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅萝拉。
轨迹重叠分析基因组范围的浓缩
Bioconductor版本:3.12
提供功能测试集重叠的基因组区域与公众和自定义区域设置(基因组范围)数据库。这个可以做自动浓缩分析基因组区域集,从而促进的解释功能基因组和表观基因组学数据。
作者:内森谢菲尔德< http://www.databio.org > (aut (cre) Christoph烈性黑啤酒(施)
维修工:内森谢菲尔德内森< code.databio.org >
从内部引用(R,回车引用(“洛拉”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“洛拉”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes(“洛拉”)
| HTML | R脚本 | 1。开始使用它 |
| HTML | R脚本 | 2。使用洛拉核心 |
| HTML | R脚本 | 3所示。选择一个宇宙 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | ChIPSeq,FunctionalGenomics,GeneRegulation,GeneSetEnrichment,GenomeAnnotation,MethylSeq,测序,软件,SystemsBiology |
| 版本 | 1.20.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.2 (r - 3.2)(5.5年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (> = 2.10) |
| 进口 | BiocGenerics,S4Vectors,IRanges,GenomicRanges,data.table,reshape2跑龙套,统计方法 |
| 链接 | |
| 建议 | 平行,testthat,knitr,BiocStyle,rmarkdown |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | simpleCache,qvalue,ggplot2 |
| URL | http://code.databio.org/LOLA |
| BugReports | http://github.com/nsheff/LOLA |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | 可可,位深蓝,米拉 |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | LOLA_1.20.0.tar.gz |
| Windows二进制 | LOLA_1.20.0.zip |
| macOS 10.13(高山脉) | LOLA_1.20.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/LOLA |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/洛拉 |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/LOLA/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
