KEGGlincs

DOI:10.18129 / B9.bioc.KEGGlincs

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见KEGGlincs．

可视化KEGG路径中的所有边并覆盖LINCS数据

Bioconductor版本:3.12

通过从KGML文件中获得的信息显式地重新创建路径映射，了解KEGG路径的“底层”发生了什么。

作者:莎娜·怀特

维护者:Shana White ， Mario Medvedovic

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“KEGGlincs”)

超文本标记语言	R脚本	KEGGlincs工作流
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	CellBiology，DataRepresentation，GeneExpression，GraphAndNetwork，KEGG，网络，NetworkInference，通路，软件，ThirdPartyClient
版本	1.16.0
在Bioconductor	BioC 3.4 (R-3.3)(4.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 3.3)，KOdata，hgu133a.db，org.Hs.eg.db(> = 3.3.0)
进口	AnnotationDbi，KEGGgraph，igraph，plyr，gtools，httr，RJSONIO，KEGGREST，方法，图形，统计，utils，XML, grDevices
链接
建议	BiocManager(> = 1.20.3),knitr，图
SystemRequirements	细胞景观(>= 3.3.0)，Java (>= 8)
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	KEGGlincs_1.16.0.tar.gz
Windows二进制	KEGGlincs_1.16.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	KEGGlincs_1.16.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/KEGGlincs
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/KEGGlincs
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/KEGGlincs/
软件包下载报告	下载数据