KEGGREST

DOI:10.18129 / B9.bioc.KEGGREST

这个包是3.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅KEGGREST。

其他客户端访问京都基因和基因组的百科全书(KEGG)

Bioconductor版本:3.12

一个包,它提供了一个客户端接口京都基因和基因组的百科全书(KEGG)其他服务器。根据j . Zhang KEGGSOAP r .绅士,和马克•卡尔森和KEGG (python包)Aurelien Mazurie。

作者:丹特南鲍姆(aut),杰里米·Volkening[所有],Bioconductor包维护者(aut (cre)

维修工:Bioconductor包维护者<维护者bioconductor.org >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“KEGGREST”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“KEGGREST”)

HTML	R脚本	访问KEGG REST API
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	注释,KEGG,通路,软件,ThirdPartyClient
版本	1.30.1
Bioconductor自	BioC 2.12 (r - 3.0)(8年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.5.0)
进口	方法,httr,png,Biostrings
链接
建议	RUnit,BiocGenerics,knitr
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	Hiiragi2013,ROntoTools
进口我	亚当,吸引,BiocSet,ChIPpeakAnno,cn,EnrichmentBrowser,famat,小伙子,计,KEGGlincs,KEGGprofile,MetaboSignal,MWASTools,NoRCE,PADOG,pathview,PathwaySplice,RnaSeqSampleSize,SBGNview,击杀,transomics2cytoscape,YAPSA
建议我	globaltest,iSEEu,莲花
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	KEGGREST_1.30.1.tar.gz
Windows二进制	KEGGREST_1.30.1.zip
macOS 10.13(高山脉)	KEGGREST_1.30.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/KEGGREST
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ KEGGREST
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/KEGGREST/
包下载报告	下载数据