iggenusage
doi：10.18129/b9.bioc.iggeneusage
该包适用于生物导体的3.12版；对于稳定的最新版本，请参阅iggenusage。
免疫库中的差异基因使用率
生物导体版本：3.12
解码免疫谱的特性是理解适应性免疫对病毒感染等挑战的反应的关键。免疫曲线分析的一项重要任务是在生物条件之间检测Ig基因使用中的偏差。Iggenusage是一种计算工具，用于分析免疫库中差异基因使用情况。它采用贝叶斯分层模型来拟合免疫库测序实验中复杂的基因使用数据，并将Ig基因使用偏差量化为概率。
作者：Simo Kitanovski [AUT，CRE]
维护者：simo kitanovski
引用（从r内，输入引用（“ iggenusage”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ iggeneusage”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ iggenuusage”）
| html | R脚本 | 用户手册：iggeneusage |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 | |
| 文本 | 执照 |
细节
| 生物浏览 | 贝叶斯，，，，差异性，，，，遗传学，，，，回归，，，，软件 |
| 版本 | 1.4.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.10（R-3.6）（1。5年） |
| 执照 | 文件执照 |
| 要看 | 方法，r（> = 3.6.0），RCPP（> = 0.12.0），总结性特征，，，，Stanheaders（> 2.18.1） |
| 进口 | rstan（> = 2.19.2），RESHAPE2（> = 1.4.3） |
| 链接 | |
| 建议 | 生物使用，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，测试（> = 2.1.0），GGPLOT2，，，，GGFORCE，，，，栅格，，，，Ggrepel |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| BugReports | https://github.com/snaketron/iggeneusage/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | iggeneusage_1.4.0.tar.gz |
| Windows二进制 | iggeneusage_1.3.1.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | iggeneusage_1.4.1.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/iggeneusage |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/iggeneusage |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/iggeneusage/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
