该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅电离。
生物导体版本:3.12
电离剂提供了牛津纳米孔奴才数据质量评估的工具。它从一组FAST5文件中提取摘要统计信息,可以在基本调用之前或之后使用。除了产生的读取类型的标准摘要外,它还提供了许多可视化指标的图,相对于实验运行时间或空间上的流动循环表面。
作者:迈克·史密斯[AUT,CRE]
维护者:迈克·史密斯(Mike Smith)
引用(从r内,输入引用(“离子”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ ioniser”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Ioniser”)
html | R脚本 | 纳米孔数据的质量评估工具 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 | |
文本 | 执照 |
生物浏览 | DataImport,,,,QualityControl,,,,测序,,,,软件 |
版本 | 2.14.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.2(R-3.2)(5。5年) |
执照 | 麻省理工学院 +文件执照 |
要看 | R(> = 3.4) |
进口 | RHDF5,,,,dplyr,,,,马格里特,,,,花花公子,,,,Shortread,,,,生物弦,,,,GGPLOT2, 方法,生物基因,,,,xvector,,,,蒂布尔,统计生物比较,,,,位64,,,,Stringr,UTILS |
链接 | |
建议 | 生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,栅格,,,,测试,,,,Minionsummarydata |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | ioniser_2.14.0.tar.gz |
Windows二进制 | ioniser_2.14.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | Ioniser_2.14.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ioniser |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/ioniser |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/ioniser/ |
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