电离

doi:10.18129/b9.bioc.ioniser

该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅电离

牛津纳米孔小兵数据的质量评估工具

生物导体版本:3.12

电离剂提供了牛津纳米孔奴才数据质量评估的工具。它从一组FAST5文件中提取摘要统计信息,可以在基本调用之前或之后使用。除了产生的读取类型的标准摘要外,它还提供了许多可视化指标的图,相对于实验运行时间或空间上的流动循环表面。

作者:迈克·史密斯[AUT,CRE]

维护者:迈克·史密斯(Mike Smith)

引用(从r内,输入引用(“离子”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ ioniser”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Ioniser”)

html R脚本 纳米孔数据的质量评估工具
PDF 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

生物浏览 DataImport,,,,QualityControl,,,,测序,,,,软件
版本 2.14.0
在生物导体中 Bioc 3.2(R-3.2)(5。5年)
执照 麻省理工学院 +文件执照
要看 R(> = 3.4)
进口 RHDF5,,,,dplyr,,,,马格里特,,,,花花公子,,,,Shortread,,,,生物弦,,,,GGPLOT2, 方法,生物基因,,,,xvector,,,,蒂布尔,统计生物比较,,,,位64,,,,Stringr,UTILS
链接
建议 生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,栅格,,,,测试,,,,Minionsummarydata
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 ioniser_2.14.0.tar.gz
Windows二进制 ioniser_2.14.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) Ioniser_2.14.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ioniser
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/ioniser
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/ioniser/
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