HelloRanges

DOI:10.18129 / B9.bioc.HelloRanges

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见HelloRanges

向床具用户介绍*Ranges

Bioconductor版本:3.12

翻译床工具命令行调用到R代码调用函数从Bioconductor *Ranges基础设施。这是为了教育新手Bioconductor用户,并比较两个框架的语法和语义。

作者:迈克尔·劳伦斯

维护者:Michael Lawrence

引文(从R内,输入引用(“HelloRanges”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“HelloRanges”)

PDF R脚本 HelloRanges教程
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 注释报道DataImportGenomeAnnotationSequenceMatching测序软件VariantAnnotation
版本 1.16.0
在Bioconductor BioC 3.4 (R-3.3)(4.5年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于 方法,BiocGenericsS4Vectors(> = 0.17.39),IRanges(> = 2.13.12),GenomicRanges(> = 1.31.10),Biostrings(> = 2.41.3),BSgenomeGenomicFeatures(> = 1.31.5),VariantAnnotation(> = 1.19.3),RsamtoolsGenomicAlignments(> = 1.15.7),rtracklayer(> = 1.33.8),GenomeInfoDbSummarizedExperiment
进口 docopt,统计,工具,效用
链接
建议 HelloRangesDataBiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我 OMICsPCA
建议我 plyranges
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 HelloRanges_1.16.0.tar.gz
Windows二进制 HelloRanges_1.16.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) HelloRanges_1.16.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/HelloRanges
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/HelloRanges
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/HelloRanges/
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  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网