此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见HelloRanges.
Bioconductor版本:3.12
翻译床工具命令行调用到R代码调用函数从Bioconductor *Ranges基础设施。这是为了教育新手Bioconductor用户,并比较两个框架的语法和语义。
作者:迈克尔·劳伦斯
维护者:Michael Lawrence
引文(从R内,输入引用(“HelloRanges”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“HelloRanges”)
R脚本 | HelloRanges教程 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 注释,报道,DataImport,GenomeAnnotation,SequenceMatching,测序,软件,VariantAnnotation |
版本 | 1.16.0 |
在Bioconductor | BioC 3.4 (R-3.3)(4.5年) |
许可证 | GPL (>= 2) |
取决于 | 方法,BiocGenerics,S4Vectors(> = 0.17.39),IRanges(> = 2.13.12),GenomicRanges(> = 1.31.10),Biostrings(> = 2.41.3),BSgenome,GenomicFeatures(> = 1.31.5),VariantAnnotation(> = 1.19.3),Rsamtools,GenomicAlignments(> = 1.15.7),rtracklayer(> = 1.33.8),GenomeInfoDb,SummarizedExperiment |
进口 | docopt,统计,工具,效用 |
链接 | |
建议 | HelloRangesData,BiocStyle |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | OMICsPCA |
建议我 | plyranges |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | HelloRanges_1.16.0.tar.gz |
Windows二进制 | HelloRanges_1.16.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | HelloRanges_1.16.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/HelloRanges |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/HelloRanges |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/HelloRanges/ |
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