HTSFilter

DOI:10.18129 / B9.bioc.HTSFilter

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见HTSFilter

筛选复制的高通量转录组测序数据

Bioconductor版本:3.12

该包实现了基于全球Jaccard相似指数的复制转录组测序数据的过滤程序,以便在一个或多个实验条件下识别低表达水平恒定的基因。

作者:Andrea Rau [cre, aut],梅丽娜·加洛平[ctb],吉勒斯·塞吕[ctb],弗洛伦斯Jaffrézic [ctb]

维护者:Andrea Rau < Andrea。Rau在inrae.fr>

引文(从R内,输入引用(“HTSFilter”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("HTSFilter")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“HTSFilter”)

超文本标记语言 R脚本 HTSFilter
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DifferentialExpressionGeneExpressionImmunoOncology归一化预处理RNASeq测序软件
版本 1.30.1
在Bioconductor BioC 2.12 (R-3.0)(8年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 4.0)
进口 刨边机DESeq2BiocParallelBiobase, utils,统计,grDevices,图形,方法
链接
建议 EDASeqtestthatknitrrmarkdownBiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我 coseq
建议我 HTSCluster
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 HTSFilter_1.30.1.tar.gz
Windows二进制 HTSFilter_1.30.1.zip
macOS 10.13 (High Sierra) HTSFilter_1.30.1.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/HTSFilter
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/HTSFilter
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/HTSFilter/
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Bioconductor

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  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网