HPAanalyze

DOI:10.18129 / B9.bioc.HPAanalyze

这个包是3.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅HPAanalyze

从人类的蛋白质图谱检索和分析数据

Bioconductor版本:3.12

提供检索功能,探索人类蛋白质图谱数据分析和可视化。

作者:安一Tran (aut (cre)

维护人员:安一Tran < trannhatanh89 gmail.com >

从内部引用(R,回车引用(“HPAanalyze”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“HPAanalyze”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“HPAanalyze”)

HTML R脚本 1。HPAanalyze快速入门指南:获取和可视化的人类蛋白质图谱(HPA)数据在一个函数
HTML R脚本 2。HPAanalyze深入:处理人类蛋白质图谱(HPA)数据在R
HTML R脚本 3所示。HPAanalyze用例:结合你的人类蛋白质图谱(HPA)查询
HTML R脚本 4所示。HPAanalyze用例:与人类蛋白质图谱(HPA)的xml文件离线
HTML R脚本 5。HPAanalyze用例:出口人类蛋白质图谱(HPA)数据为JSON
HTML R脚本 6。HPAanalyze用例:下载组织学图像从人类蛋白质图谱
HTML R脚本 99年。代码的数据HPAanalyze纸
PDF 参考手册
文本 新闻
文本 许可证

细节

biocViews CellBiology,蛋白质组学,软件,可视化
版本 1.8.1
Bioconductor自 BioC 3.8 (r - 3.5)(2.5年)
许可证 GPL-3 +文件许可证
取决于 R (> = 3.5.0)
进口 dplyr,openxlsx,ggplot2,宠物猫,xml2,统计,跑龙套,gridExtra
链接
建议 knitr,rmarkdown,devtools,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 HPAanalyze_1.8.1.tar.gz
Windows二进制 HPAanalyze_1.8.1.zip
macOS 10.13(高山脉) HPAanalyze_1.8.1.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/HPAanalyze
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ HPAanalyze
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/HPAanalyze/
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