HCAMatrixBrowser

DOI:10.18129 / B9.bioc.HCAMatrixBrowser

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见HCAMatrixBrowser．

从人类细胞图谱项目中提取和管理矩阵数据

Bioconductor版本:3.12

HCAMatrixBrowser查询HCA矩阵端点以下载表达式数据并返回标准Bioconductor对象。它使用LoomExperiment包来提供以HDF5织机格式下载的矩阵数据。

作者:马塞尔·拉莫斯[aut, cre]，马丁·摩根[aut] (0000-002-5874-8148)

维护者:Marcel Ramos < Marcel。Ramos在roswellpark.org>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("HCAMatrixBrowser")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“HCAMatrixBrowser”)

超文本标记语言	R脚本	HCAMatrix API查询
超文本标记语言	R脚本	HCAMatrixBrowser快速入门
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataRepresentation，基础设施，软件
版本	1.0.1
在Bioconductor	BioC 3.12 (R-4.0)(0.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 4.0.0)，铁砧
进口	BiocFileCache，消化，dplyr，httr，jsonlite，矩阵、方法、进步，rlang，SingleCellExperiment，统计，效用
链接
建议	BiocStyle，knitr，HCABrowser，LoomExperiment(> = 1.5.3)更正,readr
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/Bioconductor/HCAMatrixBrowser
全靠我
进口我	HCAExplorer，SingleCellMultiModal
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	HCAMatrixBrowser_1.0.1.tar.gz
Windows二进制	HCAMatrixBrowser_1.0.1.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	HCAMatrixBrowser_1.0.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/HCAMatrixBrowser
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/HCAMatrixBrowser
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/HCAMatrixBrowser/
软件包下载报告	下载数据