此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见GmicR.
Bioconductor版本:3.12
该软件包使用贝叶斯网络学习来检测由WGCNA检测到的基因模块和由xCell定义的免疫细胞签名之间的关系。它是一个假设生成工具。
作者:Richard Virgen-Slane
维护者:Richard Virgen-Slane
引文(从R内,输入引用(“GmicR”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("GmicR")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“GmicR”)
超文本标记语言 | R脚本 | GmicR_vignette |
参考手册 | ||
文本 | 许可证 |
biocViews | 贝叶斯,聚类,GUI,GeneExpression,GraphAndNetwork,ImmunoOncology,网络,NetworkInference,质量控制,软件,SystemsBiology |
版本 | 1.4.0 |
在Bioconductor | BioC 3.10 (R-3.6)(1.5年) |
许可证 | GPL-2 +文件许可证 |
取决于 | |
进口 | AnnotationDbi,猿,bnlearn,类别,DT,doParallel,foreach,gRbase,GSEABase,粮食,GOstats,org.Hs.eg.db,org.Mm.eg.db,闪亮的,WGCNA,data.table, grDevices,图形,reshape2,统计,效用 |
链接 | |
建议 | knitr,rmarkdown,testthat |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | GmicR_1.4.0.tar.gz |
Windows二进制 | GmicR_1.4.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | GmicR_1.4.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GmicR |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/GmicR |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/GmicR/ |
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