glimma
doi：10.18129/b9.bioc.glimma
该包适用于生物导体的3.12版；对于稳定的最新版本，请参阅glimma。
交互式HTML图形
生物导体版本：3.12
该软件包生成了交互式可视化，用于使用HTML页面中的Limma，Edger或Deseq2软件包的输出来分析RNA序列数据。交互是基于流行的分析结果静态表示，以提供其他信息。
作者：Shian Su [Aut，Cre]，Hasaru Kariyawasam [AUT]，Oliver Voogd [Aut]，Matthew Ritchie [AUT]，慈善法律[AUT]，Stuart Lee [CTB]，Isaac Virshup [CTB]
维护者：shian su
引用（从r内，输入引用（“ glimma”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ glimma”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ Glimma”）
| html | R脚本 | deseq2 |
| html | R脚本 | 林玛 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 | |
| 文本 | 执照 |
细节
| 生物浏览 | 差异性，，，，基因表达，，，，微阵列，，，，rnaseq，，，，报告写作，，，，测序，，，，软件，，，，可视化 |
| 版本 | 2.0.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.3（R-3.3）（5年） |
| 执照 | GPL-3 |
| 要看 | R（> = 4.0.0） |
| 进口 | htmlwidgets，，，，EDGER，，，，deseq2，，，，林玛，，，，总结性特征，统计jsonlite， 方法，S4VECTORS |
| 链接 | |
| 建议 | 测试，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，生物使用，，，，iranges，，，，基因组机，，，，普里尔 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/hasaru-k/glimmav2 |
| BugReports | https://github.com/hasaru-k/glimmav2/issues |
| 取决于我 | RNASEQ123 |
| 进口我 | Affycoretools，，，，Egsea |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | glimma_2.0.0.tar.gz |
| Windows二进制 | glimma_2.0.0.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | glimma_2.0.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/glimma |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：包装/glimma |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/glimma/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
