GladiaTOX

DOI:10.18129 / B9.bioc.GladiaTOX

这个包是3.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅GladiaTOX。

R包用于处理高内容筛选数据

Bioconductor版本:3.12

GladiaTOX R包是一个开源的、灵活的解决方案,高含量筛查在生物医学研究中数据处理和报告。GladiaTOX利用tcpl的核心功能,提供了一个扩展:它提供了一个web服务解决方案获取原始数据;计算严重程度评分和出口ToxPi格式化的文件;而且它包含一套功能来生成pdf格式的报告质量控制和数据处理。

作者:Vincenzo Belcastro (aut (cre) Dayne L滤波器(aut),史蒂芬卡诺(aut)

维护人员:PMP S.A. R < DL的支持。在pmi.com RSupport >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“GladiaTOX”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“GladiaTOX”)

HTML	R脚本	GladiaTOX
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	归一化,预处理,质量控制,软件,WorkflowStep
版本	1.6.1
Bioconductor自	BioC 3.9 (r - 3.6)(2年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 3.6.0),data.table(> = 1.9.4)
进口	DBI,RMySQL,RSQLite,numDeriv,RColorBrewer、并行、数据、方法、图形grDevices,xtable、工具、酿造,stringr,RJSONIO,ggplot2,ggrepel,tidyr跑龙套,RCurl,XML
链接
建议	roxygen2,knitr,rmarkdown,testthat,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	GladiaTOX_1.6.1.tar.gz
Windows二进制	GladiaTOX_1.6.1.zip
macOS 10.13(高山脉)	GladiaTOX_1.6.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GladiaTOX
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ GladiaTOX
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/GladiaTOX/
包下载报告	下载数据