GenomicTuples

DOI:10.18129 / B9.bioc.GenomicTuples

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见GenomicTuples

基因组元组的表示与操作

Bioconductor版本:3.12

GenomicTuples定义了用于存储基因组元组的通用容器。它旨在为基因组坐标元组提供功能,类似于genomic icranges Bioconductor包中用于基因组范围的功能。

作者:Peter Hickey [aut, cre], Marcin Cieslik [ctb], Hervé Pagès [ctb]

维护者:Peter Hickey < Peter。Hickey在gmail.com>

引文(从R内,输入引用(“GenomicTuples”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“GenomicTuples”)

超文本标记语言 R脚本 GenomicTuplesIntroduction
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DataRepresentation基础设施测序软件
版本 1.24.0
在Bioconductor BioC 3.0 (R-3.1)(6.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 4.0),GenomicRanges(> = 1.37.4),GenomeInfoDb(> = 1.15.2),S4Vectors(> = 0.17.25)
进口 方法,BiocGenerics(> = 0.21.2),Rcpp(> = 0.11.2),IRanges(> = 2.19.13),data.table, stats4, stats, utils
链接 Rcpp
建议 testthatknitrBiocStylermarkdown
SystemRequirements
增强了
URL www.github.com/PeteHaitch/GenomicTuples
BugReports https://github.com/PeteHaitch/GenomicTuples/issues
全靠我
进口我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 GenomicTuples_1.24.0.tar.gz
Windows二进制 GenomicTuples_1.24.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra) GenomicTuples_1.24.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GenomicTuples
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/GenomicTuples
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/GenomicTuples/
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