此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见GenomicTuples.
Bioconductor版本:3.12
GenomicTuples定义了用于存储基因组元组的通用容器。它旨在为基因组坐标元组提供功能,类似于genomic icranges Bioconductor包中用于基因组范围的功能。
作者:Peter Hickey [aut, cre], Marcin Cieslik [ctb], Hervé Pagès [ctb]
维护者:Peter Hickey < Peter。Hickey在gmail.com>
引文(从R内,输入引用(“GenomicTuples”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“GenomicTuples”)
超文本标记语言 | R脚本 | GenomicTuplesIntroduction |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DataRepresentation,基础设施,测序,软件 |
版本 | 1.24.0 |
在Bioconductor | BioC 3.0 (R-3.1)(6.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 4.0),GenomicRanges(> = 1.37.4),GenomeInfoDb(> = 1.15.2),S4Vectors(> = 0.17.25) |
进口 | 方法,BiocGenerics(> = 0.21.2),Rcpp(> = 0.11.2),IRanges(> = 2.19.13),data.table, stats4, stats, utils |
链接 | Rcpp |
建议 | testthat,knitr,BiocStyle,rmarkdown |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | www.github.com/PeteHaitch/GenomicTuples |
BugReports | https://github.com/PeteHaitch/GenomicTuples/issues |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | GenomicTuples_1.24.0.tar.gz |
Windows二进制 | GenomicTuples_1.24.0.zip(32位和64位) |
macOS 10.13 (High Sierra) | GenomicTuples_1.24.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GenomicTuples |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/GenomicTuples |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/GenomicTuples/ |
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