此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见GenomicDataCommons.
Bioconductor版本:3.12
以编程方式访问NIH / NCI基因组数据共享RESTful服务。
作者:Martin Morgan [aut], Sean Davis [aut, cre]
维护者:Sean Davis
引文(从R内,输入引用(“GenomicDataCommons”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“GenomicDataCommons”)
超文本标记语言 | R脚本 | 介绍访问NCI基因组数据共享 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DataImport,测序,软件 |
版本 | 1.14.0 |
在Bioconductor | BioC 3.5 (R-3.4)(4年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 3.4.0),magrittr |
进口 | 统计数据,httr,xml2,jsonlite跑龙套,rlang,readr,GenomicRanges,IRanges,dplyr,rappdirs,SummarizedExperiment,S4Vectors,宠物猫 |
链接 | |
建议 | BiocStyle,knitr,rmarkdown,DT,testthat,列表视图,ggplot2,GenomicAlignments,Rsamtools |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/GenomicDataCommonshttp://github.com/Bioconductor/GenomicDataCommons |
BugReports | https://github.com/Bioconductor/GenomicDataCommons/issues/new |
全靠我 | |
进口我 | GDCRNATools,TCGAutils |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | GenomicDataCommons_1.14.0.tar.gz |
Windows二进制 | GenomicDataCommons_1.14.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | GenomicDataCommons_1.14.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GenomicDataCommons |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/GenomicDataCommons |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/GenomicDataCommons/ |
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