GenomicDataCommons

DOI:10.18129 / B9.bioc.GenomicDataCommons

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见GenomicDataCommons

NIH / NCI基因组数据共享访问

Bioconductor版本:3.12

以编程方式访问NIH / NCI基因组数据共享RESTful服务。

作者:Martin Morgan [aut], Sean Davis [aut, cre]

维护者:Sean Davis

引文(从R内,输入引用(“GenomicDataCommons”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“GenomicDataCommons”)

超文本标记语言 R脚本 介绍访问NCI基因组数据共享
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DataImport测序软件
版本 1.14.0
在Bioconductor BioC 3.5 (R-3.4)(4年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 3.4.0),magrittr
进口 统计数据,httrxml2jsonlite跑龙套,rlangreadrGenomicRangesIRangesdplyrrappdirsSummarizedExperimentS4Vectors宠物猫
链接
建议 BiocStyleknitrrmarkdownDTtestthat列表视图ggplot2GenomicAlignmentsRsamtools
SystemRequirements
增强了
URL //www.anjoumacpherson.com/packages/GenomicDataCommonshttp://github.com/Bioconductor/GenomicDataCommons
BugReports https://github.com/Bioconductor/GenomicDataCommons/issues/new
全靠我
进口我 GDCRNAToolsTCGAutils
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 GenomicDataCommons_1.14.0.tar.gz
Windows二进制 GenomicDataCommons_1.14.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) GenomicDataCommons_1.14.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GenomicDataCommons
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/GenomicDataCommons
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/GenomicDataCommons/
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