GenEnetworkbuilder
doi：10.18129/b9.bioc.genenetworkbuilder
该包适用于生物导体的3.12版；对于稳定的最新版本，请参阅GenEnetworkbuilder。
GenEnetworkBuilder：使用芯片芯片/芯片seq数据和基因表达数据构建调节网络的生物导体包装
生物导体版本：3.12
应用芯片芯片或芯片序列以及微阵列或RNA-Seq基因表达数据的转录因子的直接或间接靶标。从芯片芯片或CHIP-SEQ输入一个TF的潜在靶标基因列表，以及基因表达结果，GenEnetworkBuilder会产生TF的调节网络。
作者：Jianhong OU，Haibo Liu，Heidi A Tissenbaum和Lihua Julie Zhu
维护者：jianhong ou
引用（从r内，输入引用（“ GenEnetworkbuilder”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ genenetworkbuilder”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ GenEnetworkbuilder”）
| html | R脚本 | GenEnetworkBuilder Vignette |
| html | R脚本 | 从基因列表中生成网络 |
| html | R脚本 | 使用Biogrid，弦 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | GraphandNetwork，，，，微阵列，，，，测序，，，，软件 |
| 版本 | 1.32.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.11（R-2.15）（8。5年） |
| 执照 | GPL（> = 2） |
| 要看 | r（> = 2.15.1），RCPP（> = 0.9.13） |
| 进口 | plyr，，，，图形，，，，htmlwidgets，，，，rgraphviz，，，，rjson，，，，XML，方法，grdevices，统计，图形 |
| 链接 | RCPP |
| 建议 | 运行，，，，生物基因，，，，rbgl，，，，尼特，，，，Simpintlists，，，，闪亮的，，，，StringDB，，，，生物使用，，，，魔术 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | GenEnetworkBuilder_1.32.0.tar.gz |
| Windows二进制 | genEnetworkbuilder_1.32.0.zip（32-和64位） |
| MacOS 10.13（高山脉） | GenEnetworkBuilder_1.32.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/genenetworkbuilder |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/genenetworkbuilder |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/genenetworkbuilder/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
