Genegeneinter

doi:10.18129/b9.bioc.genegeneinter

该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅Genegeneinter

测试基因相互作用的工具

生物导体版本:3.12

该软件包的目的是提出几种在病例对照关联研究中测试基因相互作用的方法。可以通过汇总在SNP级别(SSI)执行的SNP-SNP相互作用测试或使用Gene-Gene多维方法(GGI)方法来完成此类测试。该软件包还提出了用于图形显示结果的工具。

作者:Mathieu Emily [AUT,CRE],Nicolas Sounac [CTB],Florian Kroell [CTB],Magalie Houee-Bigot [aut]

维护者:Mathieu Emily

引用(从r内,输入引用(“ Genegeneinter”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ genegeneinter”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Genegeneinter”)

PDF R脚本 Genegeneinter简介
PDF R脚本 成对交互测试
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 遗传因素,,,,遗传学,,,,Genomewideassociation,,,,SNP,,,,软件
版本 1.16.0
在生物导体中 Bioc 3.4(R-3.3)(4。5年)
执照 GPL(> = 2)
要看 R(> = 4.0)
进口 snpstats,,,,mvtnorm,,,,rsamtools,,,,Igraph,,,,克恩拉布,,,,Factominer,,,,iranges,,,,基因组机,,,,Data.Table,Grdevices,图形,统计,UTILS,方法,ggtools
链接
建议
系统要求
增强
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取决于我
进口我
建议我
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构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 genegeneinter_1.16.0.tar.gz
Windows二进制 genegeneinter_1.16.0.zip(32-和64位)
MacOS 10.13(高山脉) genegeneinter_1.16.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/genegeneinter
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/genegeneinter
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/genegeneinter/
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